Решение о выборе платформы для хостинга должно зависеть от тех приложений, которые будут обеспечивать функционирование Вашего сайта. Если Вы уже используете ASP, VBScript, Windows Media, Microsoft Access, Microsoft SQL Server и у Вас нет времени или желания изучать приложения ориентированные на UNIX, то Вы, естественно, должны остановить свой выбор на провайдере, предоставляющем хостинг на серверах с Windows 2000 или Windows NT. Теперь, когда стоимость хостинга на платформе Windows вплотную приблизилась к стоимости хостинга на платформе UNIX, отличия в хостинге на этих платформах не стоят того времени, которое Вы потратите на их сравнение.

Это все - были скорее исключения из правил, нежели правила.
В 99% случаев хостинг-провайдеры предпочитают UNIX сервера. Главная причина - безопасность.