При запуске phpMyAdmin, Вы можете использовать следующие параметры: 'db', 'pma_username', 'pma_password' и 'server'. Последний параметр может содержать либо числовой индекс хоста (из '$i' файла конфигурации), либо одно из имен хоста, прописанных в конфигурационном файле.
Использование параметров 'pma_username' и 'pma_password' было протестировано при использовании 'cookie' аутентификации.